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核酸檢測實(shí)驗(yàn)是微觀的,基于細(xì)胞,分子,蛋白水平,而這些微觀樣本對外界環(huán)境的影響敏感,比如溫度、ph值、酶解、損傷等,在我們盡力呵護(hù)樣本的生存環(huán)境的同時,污染也是需要注意的頭等大事,要堅(jiān)決避免環(huán)境中的“雜質(zhì)”的亂入,包括樣本污染,試劑儀器交叉污染、產(chǎn)物氣溶膠污染等對實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響。“易查不易察”,污染來的悄無聲息,防不勝防,假陽性結(jié)果讓無數(shù)核酸檢測人員抓狂和崩潰。
一旦出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境污染,比如樣本之間交叉污染、試劑污染、儀器污染、陽性對照污染、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染、氣溶膠污染等,其中氣溶膠污染是一個非常重要而被忽視的污染源。實(shí)驗(yàn)室出現(xiàn)氣溶膠污染,需要較長的時間進(jìn)行*。
一、氣溶膠污染原因
1、樣本之間交叉污染。
標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染;標(biāo)本存放運(yùn)輸時,由于密封不嚴(yán)或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染;核酸模板在提取過程中,由于加樣槍污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;手動提取核酸樣本時,污染的手套觸摸離心管內(nèi)蓋導(dǎo)致的污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,導(dǎo)致彼此間的污染。
2、PCR試劑污染
PCR試劑在配制過程中,移液槍、槍頭、離心管等原因造成試劑被PCR核酸模板污染。
3、不同工作區(qū)域移液槍等耗材交叉使用。
將易污染區(qū)域的移液槍、槍頭、離心管等耗材拿到潔凈區(qū)使用引起的污染;
4、離心機(jī)轉(zhuǎn)子未定期擦拭。
離心機(jī)通常進(jìn)行各種試劑組分、不同盲樣的離心,如果離心管外部沾染病毒、陽性核酸或陽性質(zhì)粒,容易造成污染。
5、陽性對照造成的污染。
開蓋時間過長高濃度質(zhì)粒揮發(fā)到室內(nèi),陽性對照組分未使用完任意丟棄,加完陽性對照的槍頭未放入消毒液中。
6、擴(kuò)增產(chǎn)物開蓋造成的污染。
這是PCR試驗(yàn)中主要、常見的污染原因。因?yàn)镻CR產(chǎn)物拷貝量大,遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于PCR檢測拷貝的極限,PCR產(chǎn)物開蓋后,極易迅速造成擴(kuò)散,極微量的PCR產(chǎn)物污染,就可形成假陽性。
7、各個實(shí)驗(yàn)室擦桌布、掃把,簸箕,工作服交叉使用。
二、核酸檢測實(shí)驗(yàn)室如何預(yù)防污染
1、合理的實(shí)驗(yàn)分區(qū)
原則上可以設(shè)置3個獨(dú)立的工作區(qū)域:
試劑耗材儲存與準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本處理和標(biāo)本準(zhǔn)備區(qū)(核酸純化)、擴(kuò)增檢測區(qū),各區(qū)域空間*相互獨(dú)立,不能直接相通。其中試劑耗材儲存與準(zhǔn)備區(qū)必須獨(dú)立設(shè)置。
實(shí)驗(yàn)室實(shí)施空氣流向控制,擴(kuò)增前和擴(kuò)增后區(qū)域應(yīng)具有獨(dú)立通風(fēng)系統(tǒng),擴(kuò)增后區(qū)域保持負(fù)壓狀態(tài),其它區(qū)域保持正壓狀態(tài),防止擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)入擴(kuò)增前的區(qū)域。
2、實(shí)驗(yàn)操作流程:
(1)樣品制備區(qū)進(jìn)行樣品處理,核酸提??;
(2)配液區(qū)配置反應(yīng)體系:酶混合液和PCR反應(yīng)液混合,分裝至PCR反應(yīng)管;
(3)樣品制備區(qū)加樣:樣品核酸和陰陽性對照加至反應(yīng)液中;
(4)PCR擴(kuò)增區(qū)上機(jī)擴(kuò)增檢測。務(wù)必保持單向操作流程,避免各區(qū)實(shí)驗(yàn)室污染。
3、各個實(shí)驗(yàn)區(qū)內(nèi)試驗(yàn)用品專區(qū)
配液區(qū)是潔凈的試驗(yàn)區(qū)域,樣品制備區(qū)的潔凈度稍差, PCR擴(kuò)增區(qū)內(nèi)是易被污染的區(qū)域,各區(qū)之間試驗(yàn)物品專區(qū),避免因交叉使用造成實(shí)驗(yàn)室污染。
4、試驗(yàn)操作要規(guī)范
(1)正確使用移液槍,保證試劑配比和計(jì)量正確,同時避免液體吸入移液槍口造成污染。
(2)實(shí)驗(yàn)的過程中應(yīng)勤換手套,在進(jìn)出不同區(qū)域或進(jìn)行模板操作后,都應(yīng)及時更換手套。
(3)試劑盒各組分在打開之前應(yīng)先做瞬時離心(約10s),將管壁及管蓋上的液體甩至管底部,從而減少污染手套或加樣器的機(jī)會。開管動作要輕,以防管內(nèi)液體濺出或形成氣溶膠,造成污染。
(4)樣本量較多時,應(yīng)將反應(yīng)液預(yù)混,再分裝至PCR反應(yīng)管,后添加核酸模板,以減少單個添加操作繁瑣造成的污染。
(5)每次試驗(yàn)必須設(shè)定陰性對照和陽性對照,讀取結(jié)果時,在保證陰陽性對照均成立的情況下,判讀樣本結(jié)果才有效。
(6)實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,PCR反應(yīng)管嚴(yán)禁打開,及時放置殺孢子劑消毒液中浸泡。
三、解決核酸實(shí)驗(yàn)室污染方法
(1)開窗通風(fēng):如在短時間內(nèi)要消除實(shí)驗(yàn)室污染,開窗通風(fēng)促進(jìn)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)空氣流通,使停留在室內(nèi)的核酸排放到室外。
(2)紫外燈照射:將實(shí)驗(yàn)室內(nèi)好生物安全柜內(nèi)物品平鋪,打開離心機(jī)內(nèi)蓋,然后將紫外等打開照射12-24小時,通風(fēng)12小時以上。
(3)消毒液降解核酸:及時用諾福過氧化氫殺孢子劑擦拭操作臺面和儀器,按照1:10稀釋浸泡試驗(yàn)器具,同時按照1:3比例稀釋涮洗拖布擦拭地面。
(4)高壓:試驗(yàn)耗材、工作衣等進(jìn)行121℃30分鐘高壓。
(5)使用核酸污染清洗液噴灑室內(nèi)降解核酸。
(6)陽性污染特別嚴(yán)重,可以采取干霧過氧化氫消毒熏蒸實(shí)驗(yàn)室。